Sesión del 1 de sept 2015: Autoorganización en comunidades microbianas

Estimados todos,

La sesión del próximo martes correra a cargo de Juan Arias. Aprovechando les recuerdo que para el 8 tenemos “salida de campo”, es decir, es el día que Stuart Newman da su conferencia en Ciencias a la hora del seminario.

Aquí les dejo el resumen de Juan:

El estudio de las comunidades microbianas se ha enfocado generalmente en el análisis de las diferencias en los patrones de presencia/ausencia o abundancia diferencial de sus componentes individuales (normalmente definidos como OTUs) entre distintos ecosistemas para tratar de asociar cuales de estos componentes pueden estar asociados con las diferencias entre distintas comunidades. Recientemente, ha surgido un interés por entender las funciones de una comunidad más allá del simple inventario de especies y para esto el enfoque de redes comienza a ser cada vez más recurrente en los estudios de esta área. En este contexto, múltiples métodos y algoritmos han sido desarrollados para tratar de inferir relaciones estadísticamente significativa entre los OTUs identificados en cada comunidad. Una de las principales suposiciones de estos algoritmos es que las relaciones estadísticas obtenidas pueden ser mapeadas a relaciones biológicas. La validez de este supuesto no ha sido puesta a prueba de manera extensa. Zelezniak et al 2015 estudian una serie de comunidades microbianas con un enfoque de redes y a partir de estimar la capacidad metabólica de sus componentes individuales sugiere que las interacciones estadísticas pueden, en su mayoría, ser explicadas a través de interacciones metabólicas; por ejemplo la competencia entre especies por los mismos recursos en el caso de las interacciones de co-exclusión o mediante compartir metabolitos en el caso de las interacciones de co-presencia. El trabajo representa un paso en nuestro entendimiento de como las especies en una comunidad interactúan y como estas interacciones dan lugar a las organización de las comunidades microbianas.

http://www.pnas.org/content/112/20/6449.short

Saludos

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