Para el Simposio del C3

Hola,

Como algunos ya sabrán habrá un simposio del C3 en octubre y el seminario de biología teórica tiene el honor de un stand dentro de el.
La propuesta es hacer una red bipartita de los temas y artículos que hemos discutido a lo largo de los años. Para hacer la red necesitamos que nos ayuden mandando los títulos de artículos que hayan expuesto / gustado y sus palabras clave. Adjunto al final algunos ejemplos. Muchos de los artículos se pueden encontrar en este grupo, así que por favor ayúdennos a revisar los correos antiguos.

Gracias,
Mariana Esther

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18 thoughts on “Para el Simposio del C3

  1. seminario_bt

    Titulo: Bistability, Bifurcations, and Waddington’s Epigenetic Landscape
    Palabras clave: Paisaje epigenético, Waddington, diferenciación, destino celular, multiestabilidad, variación de parámetros, modelos matemáticos, ODEs

    Titulo: Contagious Cancer The evolution of a killer
    Palabras clave: cáncer, demonio de Tazmania, evolución del cáncer, ecología, epidemiología

    Titulo: Ancestral Developmental Potential Facilitates Parallel Evolution in Ants
    Palabras clave: hormigas, biología del desarrollo, expresión génica, filogenias, plasticidad fenotipo, acomodación genética, evolución, fenotipo.

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  2. seminario_bt

    Título: Pattern, growth and control.
    Lander AD.
    Cell. 2011 Mar 18;144(6):955-69.
    Palabras clave: Formación de patrones, biología del desarrollo, morfogénesis, robustez, auto-organización,


    Elizabeth

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  3. seminario_bt

    Eva Jablonka and Marion J. Lamb (2005) Evolution in Four Dimensions: Genetic, Epigenetic, Behavioral, and Symbolic Variation in the History of Life. MIT Press. ISBN 0-262-10107-6
    Palabras clave: epigenética, evolución, genética, conducta, simbólico, variación

    Susan Oyama. The Ontogeny of Information (2000).
    Palabras clave: ontogenia, información, teoría de los sistemas de desarrollo


    Mariana

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  4. Checo

    Transgenes in Mexican maize: molecular evidence and methodological considerations for GMO detection in landrace populations
    A PIÑEYRO-NELSON, J VAN HEERWAARDEN, H R PERALES, J A SERRATOS-HERNÁNDEZ, A RANGEL, M B HUFFORD, P GEPTS, A GARAY-ARROYO, R RIVERA-BUSTAMANTE, E R ÁLVAREZ-BUYLLA
    Mol Ecol. 2009 February; 18(4): 750–761. doi: 10.1111/j.1365-294X.2008.03993.x
    PMCID: PMC3001031

    Palabras clave: centros de origen, milpa, maíz, Mexico, flujo transgénico

    —————————————
    Augusto Cabrera. Aplicación del método de Lie en modelos epidemiológicos. Tesis. Facultad de Ciencias, UNAM. (2013). México, D.F.

    Palabras clave: Método de Lie, Epidemiología, modelos, biometaméticas
    —————————————–

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  5. seminario_bt

    Articulo: Huang S, Ingber DE. A non-genetic basis for cancer progression and metastasis: self-organizing attractors in cell regulatory networks. Breast disease, 26 (2006,2007) 27-54.
    Palabras clave: cancer, atractores, redes, epigenética.


    Raul Peralta

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  6. seminario_bt

    Evolutionary construction by staying together and coming together

    Corina E. Tarnita, Clifford H. Taubes, Martin A. Nowak

    Journal of Theoretical Biology 320: 10-22 (2013) DOI:10.1016/j.jtbi.2012.11.022

    Palabras Clave: Complejidad, Teoría de Juegos en Evolución, multicelularidad, división incompleta, agregación, cooperación y traición.


    Emilio Mora

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  7. seminario_bt

    Haynes, C., C. J. Oldfield, F. Ji, N. Klitgord, M. E. Cusick, P. Radivojac, V. N. Uversky, M. Vidal, L. M. Iakoucheva. 2006. Intrinsic disorder is a common feature of hub proteins from four eukaryotic interactomes. PLoS Computational Biology 2: 001-012. DOI: 10.1371/journal.pcbi.0020100

    Palabras clave. proteína, proteínas intrínsecamente desordenadas, interactoma, interacción, promiscuidad.


    Alejandra Zavala

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  8. seminario_bt

    Evolution of networks and sequences in eukaryotic cell cycle control.
    Cross FR, Buchler NE, Skotheim JM.

    Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2011 Dec 27;366(1584):3532-44. doi: 10.1098/rstb.2011.0078.

    Palabras clave: ciclo celular eucarionte, modelos de red, evolución de redes,


    Aaron Castillo

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  9. seminario_bt

    A twelve-step program for evolving multicellularity and a division of labor.

    Kirk, David L.

    BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology,
    27: 299-310 (2005) DOI:10.1002/bies.20197

    Palabras Clave: origen de multicelularidad, división del trabajo, Volvocaceae, filogenia, desarrollo, linea somática-germinal.


    Emilio Mora

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  10. seminario_bt

    Emergence of structural and dynamical properties of ecological mutualistic networks
    Samir Suweis, Filippo Simini, Jayanth R. Banavar & Amos Maritan. Nature 500, 449–452 (22 August 2013) doi:10.1038/nature12438

    Palabras clave: Ecología, redes mutualistas, redes ecológicas, emergencia, propiedades estructurales, propiedades dinámicas.

    Juan Antonio Arias del Ángel.

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  11. checo

    Prion Switching in Response to Environmental Stress

    Tyedmers, J., Madariaga, M. L., & Lindquist, S. (2008). Prion switching in response to environmental stress. PLoS biology, 6(11), e294.

    Palabras clave: priones, epigenética , evolución, evolvabilidad, proteínas

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  12. Libertad Pantoja Hernández

    Breaking the protein rules

    Chouard, Tanguy (2011) Breaking the protein rules. Nature, 471, 151-153.

    Palabras clave: proteínas, plegamiento, estructura, función, desorden, predicción.

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  13. Libertad Pantoja Hernández

    Reaction-Diffusion Model as a Framework for Understanding Biological Pattern Formation

    Kondo, Shigeru et al. (2010) Reaction-Diffusion Model as a Framework for Understanding Biological Pattern Formation. Science 329, 1616-1620

    Palabras clave: Patrones espaciales, gradientes, Turing, embriogénesis, interacciones, retroalimentación.

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  14. Mariana Esther

    Representación formal de sistemas biológicos mediante álgebras de procesos.
    Palabras clave: Álgebras de Procesos, Métodos Formales.

    -Elias

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  15. Mariana Esther

    Evolution of networks and sequences in eukaryotic cell cycle control. Cross FR, Buchler NE, Skotheim JM. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2011 Dec 27;366(1584):3532-44. doi: 10.1098/rstb.2011.0078.
    Palabras clave: ciclo celular eucarionte, modelos de red, evolución de redes,

    – Aaron

    A twelve-step program for evolving multicellularity and a division of labor.
    Kirk, David L. BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology, 27: 299-310 (2005) DOI:10.1002/bies.20197
    Palabras Clave: origen de multicelularidad, división del trabajo, Volvocaceae, filogenia, desarrollo, linea somática-germinal.

    – Emilio Mora

    Barve A, Wagner A. A latent capacity for evolutionary innovation through
    exaptation in metabolic systems. Nature. 2013 Aug 8;500(7461):203-6.
    Palabras clave: evolución molecular, redes metabólicas, exaptación.

    – Mariana Benitez

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  16. Libertad Pantoja Hernández

    Fernández, Ariel and Lynch, Michael, Nonadaptive origins of interactome complexity, Nature. 2011 May 18; 474(7352): 502–505.

    Palabras clave: proteínas, evolución estructural, topología, ortólogos, deriva, tamaño poblacional, patrones, selección natural

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  17. Libertad Pantoja Hernández

    Nonadaptive origins of interactome complexity

    Fernández, Ariel and Lynch, Michael, Nonadaptive origins of interactome complexity, Nature. 2011 May 18; 474(7352): 502–505.

    Palabras clave: proteínas, evolución estructural, topología, ortólogos, deriva, tamaño poblacional, patrones, selección natural

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